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유전학

Surveillance de Génome-large d’erreurs de Transcription dans les organismes eucaryotes

JoVE 신문
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JoVE 신문 유전학

Genome-wide Surveillance of Transcription Errors in Eukaryotic Organisms

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Surveillance de Génome-large d’erreurs de Transcription dans les organismes eucaryotes

DOI:

10.3791/57731-v

•

09:30 min

•

September 13, 2018

•

Clark Fritsch², Jean-Francois Pierre Gout⁴, Marc Vermulst

¹Center for Mitochondrial and Epigenomic Medicine,Children’s Hospital of Philadelphia, ²Department of Cellular and Molecular Biology,University of Pennsylvania, ³Department of Biological Sciences,Mississippi State University, ⁴Center for Mechanisms of Evolution, Biodesign Institute,Arizona State University

Chapters

00:04Title
00:38RNA Circularization and Rolling Circle Reverse Transcription
02:51Second Strand cDNA Synthesis and Repair
03:45Adapter Ligation and Size Selection
06:21PCR Amplification and Final Bead Purification
07:53Results: Quality Control, Bio-Informatic Analysis, and Expected Results from the C-seq Assay
08:54Conclusion

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Le présent protocole aux chercheurs un nouvel outil pour surveiller la fidélité de la transcription dans plusieurs organismes modèles.

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Dans les dosages transcription in vitro et leur application dans la découverte de médicaments

Tirer parti des ressources CyVerse pour<em> De Novo</em> Transcriptomie comparative des organismes sous-gardés (non-modèles)

Détermination de l'échelle du génome de Timing de réplication mammalienne par l'ADN Mesure Contenu

Analyse de terminaison de la transcription Utilisation d'exécution sur la transcription (TRO) Approche BrUTP brin spécifique

Cartographie génomique des interactions protéine-ADN avec ChEC-seq in<em> Saccharomyces cerevisiae</em

Cartographie de tout le génome de chromatine Accessible dans les Lymphocytes T humains primaires par ATAC-Seq

Déterminer le taux de décroissance de Genome-wide transcription dans les fibroblastes humains proliférantes et repos

Analyse en temps réel du facteur de Transcription Binding, Transcription, traduction et chiffre d’affaires pour afficher des événements mondiaux au cours de l’Activation cellulaire

Surveillance de Génome-large d’erreurs de Transcription dans les organismes eucaryotes

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Déterminer le taux de décroissance de Genome-wide transcription dans les fibroblastes humains proliférantes et repos

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