Journal
/
유전학
/
Informatic analyse van sequencedata van Batch gist 2-Hybrid schermen
JoVE 신문
유전학
JoVE 비디오를 활용하시려면 도서관을 통한 기관 구독이 필요합니다.  전체 비디오를 보시려면 로그인하거나 무료 트라이얼을 시작하세요.
JoVE 신문 유전학
Informatic Analysis of Sequence Data from Batch Yeast 2-Hybrid Screens
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Informatic analyse van sequencedata van Batch gist 2-Hybrid schermen

DOI:
10.3791/57802-v

•

09:14 min

•

June 28, 2018

•

, , ,
1Molecular Physiology and Biophysics,University of Iowa

Chapters

  • 00:04Title
  • 00:50Mapping Fastq Files
  • 02:14Bioinformatics Processing Using DEEPN Software
  • 06:08Verification of Candidates Identified by DEEPN
  • 08:01Conclusion

Summary

자동 번역

자동 번역

Diepe sequentiebepaling van gist bevolking geselecteerd voor positieve gist 2-hybrid interacties mogelijk levert een schat aan informatie over interacterende eiwitten van de partner. Hier beschrijven we de werking van specifieke bioinformatica tools en bijgewerkte software voor het analyseren van de reeks gegevens uit dergelijke schermen op maat.

Tags

Informatic AnalysisSequence DataBatch Yeast 2-hybrid ScreensProtein InteractomesBioinformatics ProcessingUser-friendly Graphic User InterfaceMolecular BiologistsCell BiologistsBiochemistsMAPster SoftwareDEEPN AnalysisHISAT2Multi-threadingReference DNA GenomeY2H Prey Library InsertsMapped FilesUnmapped Reads

Article

Embed

플레이리스트에 추가

Usage Statistics

Related Videos

Conjugative Mating Testen voor sequentie-specifieke analyse van Transfer eiwitten die betrokken zijn in bacterieconjugatie

Transcriptoom analyse<em> C</em>.<em> elegans</em> RNA Sequencing gegevens via de Tuxedo Suite op de Galaxy Project

Tweerichtings retrovirale integratie site PCR methodologie en kwantitatieve data analyse werkstroom

Bereiding van de monsters en de analyse van de RNASeq gebaseerde gen expressie gegevens uit de zebravis

Verkennen van de wortel Microbiome: extraheren van gegevens van de bacteriële Gemeenschap uit de bodem, de rhizosfeer, en de wortel Endosphere

Één molecuul fluorescentie In Situ hybridisatie (smFISH) analyse in Budding vegetatieve groei van gist en meiose

Paring gebaseerde overexpressie bibliotheek Screening in het gist

Nieuwe reeks ontdekking door subtractieve Genomics

Verbeterde gist One-hybride schermen te identificeren van de transcriptiefactor binden aan menselijke DNA-sequenties

Gepoolde CRISPR-gebaseerde genetische schermen in zoogdiercellen

Read Article