Journal
/
Immunology and Infection
/
Het combineren van de analyse van DNA in een ruwe Virion extractie met de analyse van RNA van besmette bladeren om te ontdekken van nieuwe Virus Genomes
JoVE Journal
Immunology and Infection
This content is Free Access.
JoVE Journal Immunology and Infection
Combining Analysis of DNA in a Crude Virion Extraction with the Analysis of RNA from Infected Leaves to Discover New Virus Genomes
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Het combineren van de analyse van DNA in een ruwe Virion extractie met de analyse van RNA van besmette bladeren om te ontdekken van nieuwe Virus Genomes

DOI:
10.3791/57855-v

•

08:56 min

•

July 27, 2018

•

, , ,
1Texas A&M Agrilife Center at Dallas, 2Noble Research Center,Oklahoma State University, 3Department of Biology, College of Engineering and Natural Sciences,The University of Tulsa, 4Bioinformatics and Genomics Core Facility, Department of Biochemistry and Molecular Biology,Oklahoma State University

Chapters

  • 00:04Title
  • 00:58General Virus Purification by Differential Centrifugation
  • 04:03Isolating Virion DNA by Organic Extraction
  • 05:46Results: Genomes of Two Badnavirus Species Identified from Infected Canna Lilies
  • 07:34Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Hier presenteren we een nieuwe aanpak om te identificeren plantenvirussen met dubbele streng DNA genomen. Wij gebruiken standaard methoden uittreksel DNA en RNA van besmette bladeren en uitvoeren van de volgende generatie sequencing. Bioinformatic hulpmiddelen assembleren sequenties in contigs, identificeren van contigs vertegenwoordigen virus genomen en genomen aan taxonomische groepen toewijzen.

Tags

DNA AnalysisCrude Virion ExtractionRNA AnalysisInfected LeavesNew Virus GenomesEnvironmental VirologyBadnavirusesHomogenizationDifferential CentrifugationBio-analyzerLaboratory ProtocolLeaf GrindingUreaDetergentCentrifugationPellet SeparationVirus PurificationDNA Sequencing

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

check_url/57855?article_type=v

Scheiding van enkelstrengs DNA, dubbelstrengs DNA en RNA van een milieu-Viral Gemeenschap met behulp van Hydroxyapatite Chromatografie
check_url/57855?article_type=v

Isolatie en Genoomanalyse van Single Virionen gebruik 'Single Virus Genomics'
check_url/57855?article_type=v

Affiniteit Zuivering van Influenza Virus ribonucleoproteïne Complexen van het chromatine van geïnfecteerde cellen
check_url/57855?article_type=v

Isolatie en analyse van Brain-afgezonderd Leukocyten uit<em> Plasmodium berghei</em> ANKA-geïnfecteerde muizen
check_url/57855?article_type=v

Nieuwe tools om regulatoire T-cellen van HIV-1-geïnfecteerde individuen Expand
check_url/57855?article_type=v

Snelle analyse van chromosoomafwijkingen in Muis B-lymfocyten door PNA-FISH
check_url/57855?article_type=v

In Vitro Analyse van Myd88 gemedieerde cellulaire immuunrespons op West Nile Virus mutantstam Infectie
check_url/57855?article_type=v

Neutrofielen Isolatie en analyse van hun rol in de Lymphoma Cell Gevoeligheid voor therapeutische middelen te bepalen
check_url/57855?article_type=v

Fenotypische en functionele analyse van geactiveerde regulatoire T-cellen Geïsoleerd van Chronische Lymfatische choriomeningitis-virus geïnfecteerde muizen
check_url/57855?article_type=v

Analyse van lymfocyt extravasatie gebruik van een<em> In Vitro</em> Model van het menselijk bloed-hersenbarrière

Read Article