Journal
/
Immunology and Infection
/
Att kombinera analys av DNA i en rå Virion extraktion med analysen av RNA från infekterade blad att upptäcka nya Virus arvsmassa
JoVE Journal
Immunology and Infection
This content is Free Access.
JoVE Journal Immunology and Infection
Combining Analysis of DNA in a Crude Virion Extraction with the Analysis of RNA from Infected Leaves to Discover New Virus Genomes
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Att kombinera analys av DNA i en rå Virion extraktion med analysen av RNA från infekterade blad att upptäcka nya Virus arvsmassa

DOI:
10.3791/57855-v

•

08:56 min

•

July 27, 2018

•

, , ,
1Texas A&M Agrilife Center at Dallas, 2Noble Research Center,Oklahoma State University, 3Department of Biology, College of Engineering and Natural Sciences,The University of Tulsa, 4Bioinformatics and Genomics Core Facility, Department of Biochemistry and Molecular Biology,Oklahoma State University

Chapters

  • 00:04Title
  • 00:58General Virus Purification by Differential Centrifugation
  • 04:03Isolating Virion DNA by Organic Extraction
  • 05:46Results: Genomes of Two Badnavirus Species Identified from Infected Canna Lilies
  • 07:34Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Här presenterar vi en ny metod för att identifiera växten virus med dubbel-strand DNA genomen. Vi använder standardiserade metoder att extrahera DNA och RNA från infekterade blad och genomföra nästa generations sekvensering. Bioinformatiska verktyg montera sekvenser i contigs, identifiera contigs som representerar virus arvsmassa och tilldela genomen taxonomiska grupper.

Tags

DNA AnalysisCrude Virion ExtractionRNA AnalysisInfected LeavesNew Virus GenomesEnvironmental VirologyBadnavirusesHomogenizationDifferential CentrifugationBio-analyzerLaboratory ProtocolLeaf GrindingUreaDetergentCentrifugationPellet SeparationVirus PurificationDNA Sequencing

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

check_url/57855?article_type=v

Separation av enda DNA, dubbel-strängat DNA och RNA ur miljösynpunkt Viral gemenskapen med hjälp av hydroxyapatit Kromatografi
check_url/57855?article_type=v

Isolering och Genome Analys av Single Virioner använder "enda virus Genomics '
check_url/57855?article_type=v

Affinitetsrening av ribonukleoprotein influensavirus komplex från kromatinet hos infekterade celler
check_url/57855?article_type=v

Isolering och analys av Brain-binds Leukocyter från<em> Plasmodium berghei</em> ANKA-infekterade möss
check_url/57855?article_type=v

Nya verktyg för att expandera reglerande T-celler från HIV-1-infekterade individer
check_url/57855?article_type=v

Snabb analys av kromosomavvikelser hos mus B lymfocyter från PNA-FISH
check_url/57855?article_type=v

In vitro Analys av MyD88-medierad cellulärt immunsvar till West Nile-virus mutant stam Infektion
check_url/57855?article_type=v

Neutrofil Isolering och analys för att fastställa deras roll i lymfom Cell Känslighet för terapeutiska medel
check_url/57855?article_type=v

Fenotypisk och funktionell analys av aktiverade regulatoriska T-celler isolerade från kronisk lymfatisk koriomeningitvirus-infekterade möss
check_url/57855?article_type=v

Analys av Lymphocyte Extravasation Med användning av ett<em> In Vitro</em> Modell av det mänskliga blod-hjärnbarriären

Read Article