Journal
/
Genetics
/
細胞を用いた多重 CRISPR ベース エンハンサー干渉エンハンサー機能の解剖
JoVE Journal
Genetics
This content is Free Access.
JoVE Journal Genetics
Dissection of Enhancer Function Using Multiplex CRISPR-based Enhancer Interference in Cell Lines
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

細胞を用いた多重 CRISPR ベース エンハンサー干渉エンハンサー機能の解剖

DOI:
10.3791/57883-v

•

10:46 min

•

June 02, 2018

•

, ,
1Department of Oncological Sciences, Huntsman Cancer Institute,University of Utah

Chapters

  • 00:05Title
  • 00:37Guide RNA Design
  • 03:37Guide RNA Cloning
  • 06:27Transfection of Enhancer-I, Cell Harvest, and RNA Extraction
  • 08:21Results: Guide RNA Design/Cloning and Evaluation of Gene Expression in Response to Enhancer-i
  • 09:23Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

このプロトコルでは、デザインを多重化融合タンパク質として知られているエンハンサー干渉 (エンハンサー-i) SID4X-dCas9-KRAB にエンハンサーのターゲットを実行するために必要な手順について説明します。このプロトコルにより、遺伝子発現調節エンハンサーの同定と共通のターゲット遺伝子を調節するエンハンサー関係の解剖が容易になります。

Tags

CRISPREnhancer InterferenceGene RegulationTranscriptionGuide RNA DesignE-CRISPUCSC Genome BrowserBLATGenome AssemblyOff-targetProtospacer-adjacent MotifGenomics

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

check_url/57883?article_type=v

角膜上皮創傷治癒中の熱ショックタンパク質27の機能のRNA干渉ベースの調査
check_url/57883?article_type=v

レアリンパ集団の不均一性を特徴づけるためにマルチプレックスRT-qPCRのを使用した単一細胞の遺伝子発現
check_url/57883?article_type=v

単一細胞のシーケンシングを使用したコピー数変化の検出
check_url/57883?article_type=v

マウスT細胞株におけるクロマチン免疫沈降（ChIP）
check_url/57883?article_type=v

マウス卵母細胞を減数分裂の間に人間の遺伝子の機能を評価するために使用私
check_url/57883?article_type=v

CRISPR Cas を用いた哺乳類細胞におけるゲノム編集
check_url/57883?article_type=v

メキシコの血脈遺伝子機能の操作
check_url/57883?article_type=v

精製と筋前駆細胞移植派生エクソソーム デュシェンヌ型筋ジストロフィー マウスの心機能を改善するために
check_url/57883?article_type=v

非正規の開いたリーディング ・ フレームから翻訳された蛋白質を発表する OpenProt データベースを利用した質量分析を用いたプロテオミクス解析
check_url/57883?article_type=v

EVOLVER を用いた自動、高スループット、連続細胞増殖実験の設計

Read Article