प्रवाह cytometric विश्लेषण शुद्ध संस्कृतियों की जांच और माइक्रोबियल समुदाय गतिशीलता की निगरानी के लिए मूल्यवान साबित कर दिया है । हम तीन व्यापक कार्यप्रवाह, नमूना से डेटा विश्लेषण करने के लिए, स्पष्ट माध्यम में शुद्ध संस्कृतियों और जटिल समुदायों के लिए के रूप में अच्छी तरह के रूप में चुनौतीपूर्ण मैट्रिक्स में क्रमशः प्रस्तुत करते हैं ।