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면역학 및 감염병학
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Automatisierte bildbasierte Quantifizierung von neutrophilen extrazellulären Fallen mit NETQUANT
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면역학 및 감염병학
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JoVE 신문 면역학 및 감염병학
Automated Image-Based Quantification of Neutrophil Extracellular Traps Using NETQUANT
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Automatisierte bildbasierte Quantifizierung von neutrophilen extrazellulären Fallen mit NETQUANT

DOI:
10.3791/58528-v

•

07:33 min

•

November 27, 2019

•

,
1Department of Clinical Sciences, Division of Infection Medicine,Lund University

Chapters

  • 00:04Title
  • 00:34Analysis and Quantification of Neutrophil Extracellular Traps (NETs)
  • 02:19Segmentation of Cells in the DNA Channel and the NET Channel
  • 03:41Single-cell Analysis of Identifiable Properties
  • 04:19Comparison of Cell Properties to Identify NET-forming Cells
  • 05:23Result Outputs Demeanor
  • 06:16Results: Analysis of NET Formation
  • 07:07Conclusion

Summary

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Hier stellen wir ein Protokoll zur Erzeugung von neutrophilen extrazellulären Fallen (NETs) und zum Betrieb von NETQUANT vor, einer vollautomatischen Softwareoption zur Quantifizierung von NETs in Immunfluoreszenzbildern.

Tags

NETQUANTAutomated Image AnalysisNeutrophil Extracellular Traps (NETs)Immunofluorescence ImagingImage SegmentationAdaptive SegmentationDNA ChannelNET ChannelSample TypesBatch ProcessingImage MetadataZenodoNordonfelt Lab

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