This content is Free Access.
1Department of Chemical and Product Safety,German Federal Institute for Risk Assessment (BfR), 2Deutsches Rheuma-Forschungszentrum (DRFZ) Berlin, a Leibniz Institute, 3Charité Universitätsmedizin Berlin, 4Applied Systems Biology,Leibniz Institute for Natural Product Research and Infection Biology Hans Knöll Institute
Chapters
- 00:04Title
- 01:11Reconstruct the 3D Image
- 03:13Transform the 3D Reconstructed Surfaces into 2D Projections
- 04:28Find the Periphery and Calculate the Fourier Components using Fiji
- 05:13Self-Organizing Maps
- 06:53Results: Robustness of SOM Mapping Approach
- 08:32Conclusion
Hier bieden we een workflow waarmee de identificatie van gezonde en pathologische cellen op basis van hun 3-dimensionale vorm. Beschrijven we het proces van het gebruik van 2D-projectie contouren op basis van het 3D-oppervlak te trainen een Self-Organizing kaart dat zorgt voor objectieve clustering van de onderzochte cel populaties.
