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Analisi metagenomica quasi di Salmonella da campioni ambientali e alimentari
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JoVE 신문 생물학
Quasi-metagenomic Analysis of Salmonella from Food and Environmental Samples
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Analisi metagenomica quasi di Salmonella da campioni ambientali e alimentari

DOI:
10.3791/58612-v

•

06:12 min

•

October 25, 2018

•

Chapters

  • 00:04Title
  • 00:30Sample Preparation
  • 01:39Immunomagnetic Separation (IMS) and Multiple Displacement Amplification (MDA)
  • 03:37Real-time PCR and Library Preparation for Quasimetagenomic Sequencing
  • 04:52Results: RT-PCR Amplifies DNA from Two Brands of Salmonella Contaminated Chicken Breast
  • 05:19Conclusion

Summary

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Qui, presentiamo un protocollo per preparare campioni di DNA da alimentare e ambientale microbiomi per rilevamento concertato e tipizzazione di Salmonella mediante sequenziamento di quasimetagenomic. L'uso combinato di arricchimento della cultura, separazione immunomagnetica (IMS) e cilindrata più amplificazione (MDA) permette efficace concentrazione del DNA genomico di Salmonella da campioni ambientali e alimentari.

Tags

Keywords: SalmonellaQuasi-metagenomic AnalysisFood SampleEnvironmental SamplePathogen DetectionGenetic FingerprintingRV Enrichment BrothCentrifugationAnti-Salmonella BeadsMagnetic SeparationMultiple Displacement Amplification (MDA)

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