Single-cell RNA Sequencing of Fluorescently Labeled Mouse Neurons Using Manual Sorting and Double <em>In Vitro</em> Transcription with Absolute Counts Sequencing (DIVA-Seq)

Anirban Paul; Z. Josh Huang

doi:10.3791/58690

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Séquençage de l’ARN des cellules individuelles des neurones de souris fluorescent étiquetés à l’aide de tri manuel et Double Transcription In Vitro de chefs absolus séquençage (DIVA-Seq)

JoVE 신문
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Single-cell RNA Sequencing of Fluorescently Labeled Mouse Neurons Using Manual Sorting and Double In Vitro Transcription with Absolute Counts Sequencing (DIVA-Seq)

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Séquençage de l’ARN des cellules individuelles des neurones de souris fluorescent étiquetés à l’aide de tri manuel et Double Transcription In Vitro de chefs absolus séquençage (DIVA-Seq)

DOI:

10.3791/58690-v

•

07:49 min

•

October 26, 2018

•

Anirban Paul, Z. Josh Huang

¹Cold Spring Harbor Laboratory

Chapters

00:04Title
00:43Preparation for Dissection and Neuron Sorting
02:09Brain Sectioning and Cell Dissociation
04:15Manual Sorting of Fluorescently Labeled Mouse Neurons
05:59Results: Microdissection of GABAergic Neurons
07:24Conclusion

Summary

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Ce protocole décrit le manuel de procédure pour isoler les neurones fluorescent étiquetés suivies in vitro l’amplification des ARNm axée sur la transcription pour l’ordonnancement de RNA seule cellule haute-profondeur de tri.

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Usage Statistics

Approche non-Laser Microscopie Capture pour la microdissection des régions discrètes du cerveau de souris pour l'ARN isolement total et en aval séquençage de nouvelle génération et de profil d'expression génique

Profilage voltage-dépendants expression d'ARNm de potassium dans les neurones Canal nigrales utilisant une seule cellule de RT-PCR

Une seule cellule de profilage de développer et d'âge mûr neurones de la rétine

Imagerie en temps réel des axonale Transport de Quantum Dot marqué BDNF dans les neurones primaires

Identification fiable de la vie Neurones Dopaminergiques dans les cultures Mésencéphale utilisant l'ARN Séquençage et TH-promoteur-driven eGFP Expression

L'ARN monocellulaire-séquentiel des sous-ensembles définis des cellules ganglionnaires rétiniennes

Un test In Vivo barrière hémato - encéphalique perméabilité chez la souris à l’aide de fluorescent marqué traceurs

Identification des Sites de facteur de Transcription Olig2 génomique fixation aiguë purifiée cellules PDGFRα + par immunoprécipitation de la chromatine Low-cellule analyse de séquençage