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決定の 3' 末端と HIV-1 の間に初期の一本鎖のウイルス DNA 分子のシーケンスを逆に感染細胞における転写
JoVE 신문
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JoVE 신문 유전학
Determining 3′-Termini and Sequences of Nascent Single-Stranded Viral DNA Molecules during HIV-1 Reverse Transcription in Infected Cells
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決定の 3' 末端と HIV-1 の間に初期の一本鎖のウイルス DNA 分子のシーケンスを逆に感染細胞における転写

DOI:
10.3791/58715-v

•

13:07 min

•

January 30, 2019

•

, ,
1Department of Infectious Diseases, School of Immunology & Microbial Sciences,King’s College London

Chapters

  • 00:04Title
  • 00:32HIV-1 DNA Enrichment by Hybrid Capture
  • 03:54Adaptor Ligation
  • 06:03Adaptor Removal and Size Separation
  • 09:36DNA Extraction
  • 11:13Results: Characterization of Nascent Retroviral cDNAs within HIV-1 Infected Cells
  • 12:40Conclusion

Summary

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初期 3' 末端の公平な測定だけでなく、単一座礁させた DNA の分子の変異プロファイルを提供するディープ シーケンス アプローチをご紹介します。メイン アプリケーションは、初期のレトロ ウイルス相補的 Dna (Cdna)、レトロ ウイルスの逆転写の過程で生成される中間体の特性です。

Tags

Keywords: HIV-1 Reverse TranscriptionNascent Single-stranded Viral DNA3′-terminiRetrovirologyCellular Restriction FactorsAntiretroviral DrugsHybrid CapturePCR WorkstationMagnetic Streptavidin BeadsBiotinylated OligonucleotidesDNA DenaturationDNA Hybridization

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