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인간의 DNA 시퀀스에 바인딩 전사 요소를 식별 하기 위해 향상 된 효 모 한 하이브리드 화면

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JoVE 신문 유전학

Enhanced Yeast One-hybrid Screens To Identify Transcription Factor Binding To Human DNA Sequences

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인간의 DNA 시퀀스에 바인딩 전사 요소를 식별 하기 위해 향상 된 효 모 한 하이브리드 화면

DOI:

10.3791/59192-v

•

11:25 min

•

February 11, 2019

•

Shaleen Shrestha*¹, Xing Liu*¹, Clarissa Stephanie Santoso*¹, Juan Ignacio Fuxman Bass²

¹Department of Biology,Boston University, ²Bioinformatics Program,Boston University

Chapters

00:04Title
00:49Spotting a Transcription Factor (TF) Array
04:19Enhanced Yeast One-hybrid (eY1H) Screen
08:48Results: Examples of eY1H Readout Plates and Potential Problems
10:28Conclusion

Summary

자동 번역

여기, 우리는 향상 된 효 모 프로토콜 식별 관심 인간의 DNA 영역을 바인딩할 수 있는 녹음 방송 요인 (TFs)을 심사 한 하이브리드 제시. 이 메서드 사용 하 여 높은 처리량 검열 파이프라인의 바인딩 심문 수입니다 > 1000 TFs 단일 실험에서.

Tags

Keywords: Transcription Factor Yeast One-hybrid DNA Sequence Functional Genomics Gene Promoters Enhancers Non-coding Variants Array Robot High Density 96-well Plates 384-well Plates 1536-well Plates Colony Array Sc Minus Tryptophan

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