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Estudio de interactianos de ARN de la proteína quinasa activada por ARN durante el ciclo de la célula mamífera
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JoVE 신문 생화학
Studying RNA Interactors of Protein Kinase RNA-Activated during the Mammalian Cell Cycle
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Estudio de interactianos de ARN de la proteína quinasa activada por ARN durante el ciclo de la célula mamífera

DOI:
10.3791/59215-v

•

10:05 min

•

March 05, 2019

•

, ,
1Department of Chemical and Biomolecular Engineering and KI for Health Science and Technology (KIHST),Korea Advanced Institute of Science and Technology (KAIST)

Chapters

  • 00:04Title
  • 01:24Preparation of S or M Phase-arrested Cells
  • 02:19Formaldehyde Cross-linking
  • 04:49Immunoprecipitation
  • 07:32Results: Capturing and Analyzing PKR-interacting RNAs During the Cell Cycle Using qRT-PCR
  • 08:45Conclusion

Summary

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Presentamos aproximaciones experimentales para estudiar interactianos de RNA de doble cadena RNA Unión proteína quinasa RNA-activado (PKR) durante el ciclo celular mamífero con células HeLa. Este método utiliza formaldehído complejos RNA-PKR la reticulación y la inmunoprecipitación para enriquecer PKR-limite RNAs. Estos RNAs pueden analizarse más a través de la secuenciación de alto rendimiento o qRT-PCR.

Tags

Keywords: RNA InteractorsProtein Kinase RNA-ActivatedMammalian Cell CycleCrosslinkingFormaldehydeImmunoprecipitationNeurodegenerative DiseaseParkinson’s DiseaseAlzheimer’s DiseaseDouble-stranded RNARNA-binding ProteinsPost-transcriptional RegulationGene ExpressionCell Cycle ArrestHeLa CellsThymidineNocodazole

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