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複数の公的にアクセス可能なデータベースを用いた乳癌におけるバイオマーカーのデータマイニングと統合的解析の実行

JoVE 신문
암 연구학

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JoVE 신문 암 연구학

Performing Data Mining And Integrative Analysis Of Biomarker in Breast Cancer Using Multiple Publicly Accessible Databases

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複数の公的にアクセス可能なデータベースを用いた乳癌におけるバイオマーカーのデータマイニングと統合的解析の実行

DOI:

10.3791/59238-v

•

07:41 min

•

May 17, 2019

•

Min-na Chen, De Zeng, Zhuo-qun Zheng, Zheng Li, Jian-le Wu, Jun-yu Jin, He-jia Wang, Cui-zhen Huang, Hao-yu Lin

¹Department of Thyroid and Breast Surgery,First Affiliated Hospital of Shantou University Medical College, ²Department of Medical Oncology,Cancer Hospital of Shantou University Medical College, ³Shantou University Medical College

Chapters

00:04Title
01:15Expression Pattern Analysis
01:58Expression Correlation Analysis
02:22Subgroup Analysis
03:35Survival Analysis
05:08Results: Data Mining and Integrative Analysis using Multiple Publicly Accessible Databases
07:13Conclusion

Summary

자동 번역

ここでは、一般にアクセス可能なさまざまなデータベースに由来するプールされた臨床データセットの包括的な分析に基づいて、乳がんのバイオマーカーと生存率予測を探索するためのプロトコルを紹介し、表現の戦略、相関関係、および生存時間分析ステップバイステップ

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Keywords: Data Mining Integrative Analysis Biomarker Breast Cancer Public Databases ONCOMINE BC Gene-Expression Miner GOBO Gene Expression Survival Predictor Molecular Subtypes Data Visualization Data Interpretation

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