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1Stream Biofilm and Ecosystem Research Laboratory, School of Architecture, Civil and Environmental Engineering,Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne, 2Plateforme technique, School of Architecture, Civil and Environmental Engineering,Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne, 3Water Chemistry and Water Technology, Engler-Bunte-Institut,Karlsruhe Institute of Technology, 4Thorlabs GmbH
Chapters
- 00:04Title
- 01:23Overview of Experimental Setup
- 01:41Setup of the Positioning Device
- 02:15Optical Coherence Tomography Setup
- 02:52Image Acquisition
- 06:08Image Correction and Display
- 08:14Results: Effect of Flow Velocity on Biofilm Growth
- 09:10Conclusion
Os biofilmes microbianos formam arquiteturas complexas em interfases e se desenvolvem em padrões espaciais altamente dependentes de escala. Aqui, apresentamos um sistema experimental (Hard-e software) para a aquisição automatizada de conjuntos de dados de tomografia de coerência óptica 3D (OCT). Este conjunto de ferramentas permite a caracterização não invasiva e em várias escalas da morfogênese do biofilme no espaço e no tempo.
Tags
3D Optical Coherence TomographyBiofilm MorphogenesisAutomated SystemLarge Spatial ScalesExtended Time PeriodsEcosystem ProcessesNatural SystemsEngineered EnvironmentsPrecision Positioning DevicePlexiglass FlumeGRBL ServerMicrofluidic DevicesFlow ChambersFlumesFiltration SystemsOCT SystemImage AcquisitionPositioning DeviceDovetail HolderImmersion Adapter
