Journal
/
유전학
/
Massespektrometri-baseret Proteomics analyser ved hjælp af OpenProt Database til at afsløre nye proteiner oversat fra ikke-kanoniske åbne læserammer
JoVE 신문
유전학
This content is Free Access.
JoVE 신문 유전학
Mass Spectrometry-Based Proteomics Analyses Using the OpenProt Database to Unveil Novel Proteins Translated from Non-Canonical Open Reading Frames

Massespektrometri-baseret Proteomics analyser ved hjælp af OpenProt Database til at afsløre nye proteiner oversat fra ikke-kanoniske åbne læserammer

DOI:
10.3791/59589-v

•

07:38 min

•

April 11, 2019

•

,
1Department of Biochemistry,Université de Sherbrooke, 2PROTEO,Quebec Network for Research on Protein Function, Structure, and Engineering

Chapters

  • 00:04Title
  • 00:52OpenProt Database Download
  • 01:53Database Handling
  • 02:41Mass Spectrometry File Preparation
  • 03:13Protein Quantification
  • 04:13Quality Control and OpenProt Database Mining
  • 05:25Results: Representative Interactor and Mass Spectrometry Identification of a Novel Protein
  • 06:40Conclusion

Summary

자동 번역

자동 번역

OpenProt er en frit tilgængelig database, der gennemtvinger en polycistronic model af eukaryote genomer. Vi præsenterer her, en protokol til brug af OpenProt databaser når spørgekriterierne massespektrometri datasæt. Ved hjælp af OpenProt database til analyse af proteom eksperimenter giver mulighed for opdagelsen af romanen og tidligere målbart proteiner.

Tags

Mass SpectrometryProteomicsOpenProt DatabaseNon-canonical Open Reading FramesNovel ProteinsProteomeProteomic AnalysesDatabase HandlingMS Convert ToolMzML File Format

Article

Embed

플레이리스트에 추가

Usage Statistics

Related Videos

subtypning af<em> Campylobacter jejuni</em> Ssp.<em> doylei</em> Isolater Brug massespektrometri-baserede PhyloProteomics (MSPP)

Novel RNA-bindende proteiner Isolering af den hurtige metode

Konjugering Parring Analyser for Sekvens-specifik analyse af Transfer proteiner involveret i konjugation

Fra et naturligt produkt til sin biosyntesegen Cluster: En Demonstration Brug Polyketomycin fra<em> Streptomyces diastatochromogenes</em> Tü6028

Bestemmelse af Optimal kromosomale placering for en DNA Element i Escherichia coli ved hjælp af en roman Transposon-medieret tilgang

Tilpasning af hybridisering fange af kromatin-associerede proteiner for Proteomics til pattedyrceller

Ved hjælp af musen oocyter at vurdere menneskelige genfunktion under meiose jeg

En Fast og kvantitativ metode til posttranslationel modifikation og Variant aktiveret kortlægning af peptider til genomer

At udforske effekter rumflyvninger på musen fysiologi ved hjælp af den åbne adgang NASA GeneLab Platform

Ved hjælp af in Vitro og i celler form at undersøge lille molekyle induceret Pre-mRNA strukturelle ændringer

Read Article