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JoVE 신문 유전학
An Assay for Quantifying Protein-RNA Binding in Bacteria

Um ensaio para quantificar a ligação de RNA de proteína em bactérias

DOI:
10.3791/59611-v

•

07:02 min

•

June 12, 2019

•

, , , ,
1Department of Biotechnology and Food Engineering,Technion-Israel Institute of Technology, 2Russell Berrie Nanotechnology Institute,Technion-Israel Institute of Technology

Chapters

  • 00:04Title
  • 00:44Design of Binding-site Plasmids
  • 02:12Design and Construction of the RBP Plasmid
  • 03:11Experiment Setup
  • 04:56Results: Quantifying Protein-RNA Binding in Bacteria
  • 06:32Conclusion

Summary

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Neste método, nós quantificamos a afinidade obrigatória de proteínas de ligação do RNA (rbps) aos locais de ligação cognato e non-cognato usando um simples, vivo, ensaio do repórter em pilhas bacterianas. O ensaio é baseado na repressão de um gene repórter.

Tags

Protein-RNA BindingRNA Binding ProteinRBP-RNA AffinityIn VivoPlasmid DesignBinding Site CassetteMCherry Reporter GeneRBP SequenceBacterial TransformationGlycerol Stocks

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