Journal
/
유전학
/
De volgende-generatie van RNA het rangschikken en een bioinformatica pijpleiding om uitgedrukte lijn-1S op het Locus-specific niveau te identificeren
JoVE 신문
유전학
This content is Free Access.
JoVE 신문 유전학
RNA Next-Generation Sequencing and a Bioinformatics Pipeline to Identify Expressed LINE-1s at the Locus-Specific Level
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

De volgende-generatie van RNA het rangschikken en een bioinformatica pijpleiding om uitgedrukte lijn-1S op het Locus-specific niveau te identificeren

DOI:
10.3791/59771-v

•

11:04 min

•

May 19, 2019

•

, , , , ,
1Tulane Cancer Center,Tulane University, 2Department of Pathology,Tulane University, 3Department of Structural and Cellular Biology,Tulane University, 4Department of Epidemiology,Tulane University

Chapters

  • 00:04Title
  • 00:52Read Alignment Pipeline to Identify Expressed L1s
  • 02:48Manual Curation
  • 07:48Assess Mappability of Each L1 Loci to Factor in a Transcription Level Correction Score
  • 08:42Results: Identification of Full-length L1 Retroelements in the Human Prostate Tumor Cell Line, DU145
  • 10:01Conclusion

Summary

자동 번역

자동 번역

Hier presenteren we een Bioinformatic aanpak en analyses om lijn-1 expressie te identificeren op de Locus specifieke niveau.

Tags

Keywords: RNA-sequencingNext-generation SequencingBioinformatics PipelineLINE-1Mobile ElementsGenetic InstabilityL1 TranscriptsCytoplasmic RNAPolyadenylated TranscriptsAlignment StrategyStrand SeparationRead CountsL1 Loci

Article

Embed

플레이리스트에 추가

Usage Statistics

Related Videos

check_url/kr/59771?article_type=v

Detectie van Copy Number Wijzigingen met behulp van Single Cell Sequencing
check_url/kr/59771?article_type=v

Optimalisatie en Vergelijkende Analyse van Plant Organellaire DNA Verrijkingsmethoden Geschikt voor Volgend Sequencing
check_url/kr/59771?article_type=v

Next-generation Sequencing en Bioinformatics pijpleiding om te evalueren van genetische determinanten van constitutionele ziekte gericht
check_url/kr/59771?article_type=v

RNA Pull-down te identificeren van RNA doelen van een lang niet-coderende RNA Procedure
check_url/kr/59771?article_type=v

Versterking van in de buurt van Full-length HIV-1 Proviruses voor Next-Generation Sequencing
check_url/kr/59771?article_type=v

High-throughput identificatie van regelgevende gensequenties met behulp van Next-generation Sequencing van circulaire chromosoom conformatie Capture (4C-seq)
check_url/kr/59771?article_type=v

Generatie van kanker cel klonen te visualiseren Telomere Repeat-bevattende RNA TERRA uitgedrukt uit een enkele Telomere in levende cellen
check_url/kr/59771?article_type=v

Verbeterde gist One-hybride schermen te identificeren van de transcriptiefactor binden aan menselijke DNA-sequenties
check_url/kr/59771?article_type=v

Sequentie ruimte verkennen om bindende sites te identificeren voor regulatoire RNA-bindende eiwitten
check_url/kr/59771?article_type=v

Een bioinformatica-pijpleiding om de MicroRNA Transcriptomes in fabrieken nauwkeurig en efficiënt te analyseren

Read Article