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Chapters
- 00:04Title
- 01:04Preparation of DNA Templates
- 01:38Reverse Transcription
- 02:24Purification of cDNA:RNA Hybrids Using Magnetic Beads
- 03:42Cap-trapping
- 05:16Control of Degradation Level and Determination of the Number of PCR Cycles
- 05:39Results: DNA Quality and Validation of SLIC-CAGE Libraries
- 06:26Conclusion
Cap Analysis of Gene Expression (CAGE) ist eine Methode zur genomweiten quantitativen Kartierung von mRNA 5'ends zur Erfassung von RNA-Polymerase-II-Transkriptionsstartstellen mit einer einzigen Nukleotid-Auflösung. Diese Arbeit beschreibt ein Low-Input-Protokoll (SLIC-CAGE) zur Erzeugung hochwertiger Bibliotheken mit Nanogramm-Mengen von Gesamt-RNA.
