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Oncogenic जीन फ्यूजन जांच लंगर मल्टीप्लेक्स पॉलिमरेज चेन रिएक्शन का उपयोग अगली पीढ़ी अनुक्रमण द्वारा पीछा किया
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JoVE 신문 암 연구학
Oncogenic Gene Fusion Detection Using Anchored Multiplex Polymerase Chain Reaction Followed by Next Generation Sequencing
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Oncogenic जीन फ्यूजन जांच लंगर मल्टीप्लेक्स पॉलिमरेज चेन रिएक्शन का उपयोग अगली पीढ़ी अनुक्रमण द्वारा पीछा किया

DOI:
10.3791/59895-v

•

09:49 min

•

July 05, 2019

•

, ,
1Department of Pathology,University of Colorado – Anschutz Medical Campus

Chapters

  • 00:04Title
  • 00:49Random Priming and First Strand cDNA Synthesis
  • 01:55Ligation Step 2 and Bead Purification
  • 04:25First PCR and Bead Purification
  • 05:48Library Quantitation and Sequencing
  • 07:41Assay Data Interpretation
  • 08:39Results: Sample Summary and Fusion Calls
  • 09:27Conclusion

Summary

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यह लेख नैदानिक ठोस ट्यूमर के नमूनों में oncogenic जीन संलयन के लिए आकलन करने के लिए अगली पीढ़ी के अनुक्रमण के बाद एक लंगर मल्टीप्लेक्स पॉलिमरेज श्रृंखला प्रतिक्रिया आधारित पुस्तकालय तैयारी किट के उपयोग का विवरण। दोनों गीला बेंच और डेटा विश्लेषण कदम वर्णित हैं.

Tags

Gene Fusion DetectionAnchored Multiplex PCRNext-generation SequencingOncogenic Gene FusionsTumor SamplesFormulative FixationDiagnosisPrognosisTreatment SelectionArtifactsRandom PrimingFirst Strand CDNA SynthesisSecond Strand CDNA SynthesisBead PurificationMolecular Barcode Adapter

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