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用于隔离和测序微RNA并使用开源工具分析微RNA的完整管道
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JoVE 신문 유전학
A Complete Pipeline for Isolating and Sequencing MicroRNAs, and Analyzing Them Using Open Source Tools
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用于隔离和测序微RNA并使用开源工具分析微RNA的完整管道

DOI:
10.3791/59901-v

•

00:09 min

•

August 21, 2019

•

, ,
1Division of Medical Genetics,University of Washington School of Medicine

Chapters

  • 00:04Title
  • 00:513’ Adaptor Ligation
  • 04:465’ Linker Ligation
  • 05:44Reverse Transcription (RT)
  • 06:33PCR Amplification and Agarose Gel Purification
  • 08:10Results: Representative MicroRNA Analyses
  • 08:49Conclusion

Summary

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在这里，我们描述了一个分步策略，用于隔离小型RNA、丰富微RNA和为高通量测序准备样本。然后，我们介绍如何使用开源工具处理序列读取并将其与微RNA对齐。

Tags

MicroRNARNA SequencingBioinformaticsGel PurificationSmall RNARNA IsolationGene TherapyDisease Mechanism

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