ここでは、RNAシーケンシングおよびRT-qPCRに対するショウジョウバエ男性アクセサリー腺(二次細胞)から特定の細胞集団を解離し、ソートするプロトコルを提示する。細胞分離は、解剖、プロテアーゼ消化および機械的分散を必要とする多段階解離プロセス後のGFP発現二次細胞のFACS精製によって達成される。