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암 연구학

Analyse des facteurs d'expression des gènes tumoraux avec le portail Web CorExplorer

JoVE 신문
암 연구학

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JoVE 신문 암 연구학

Analyzing Tumor Gene Expression Factors with the CorExplorer Web Portal

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Analyse des facteurs d'expression des gènes tumoraux avec le portail Web CorExplorer

DOI:

10.3791/60431-v

•

08:00 min

•

October 11, 2019

•

Shirley Pepke, William M. Nelson, Greg Ver Steeg

¹Lyrid LLC, ²Independent consultant, ³Information Sciences Institute,University of Southern California

Chapters

00:04Title
00:41Exploring Factors Containing a Gene of Interest
03:06Filtering and Interpreting CorEx Factors and Finding Commonalities and Differences of Gene Expression Variation Across Tumor Types
05:49Results: Representative Tumor Gene Expression Factor Analysis
07:31Conclusion

Summary

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Nous introduisons le portail Web CorExplorer, une ressource pour l'exploration des facteurs de séquençage de l'ARN tumoral trouvés par l'algorithme d'apprentissage automatique CorEx (Correlation Explication), et montrons comment les facteurs peuvent être analysés par rapport à la survie, les annotations de base de données, interactions protéines-protéines, et les uns les autres pour obtenir un aperçu de la biologie tumorale et des interventions thérapeutiques.

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