Journal
/
생물학
/
IR-TEx: en åpen kilde data integrasjon verktøyet for stor data Transcriptomics designet for malaria Vector Anopheles gambiae
JoVE 신문
생물학
This content is Free Access.
JoVE 신문 생물학
IR-TEx: An Open Source Data Integration Tool for Big Data Transcriptomics Designed for the Malaria Vector Anopheles gambiae

IR-TEx: en åpen kilde data integrasjon verktøyet for stor data Transcriptomics designet for malaria Vector Anopheles gambiae

DOI:
10.3791/60721-v

•

08:22 min

•

January 15, 2020

•

, , , ,
1Vector Biology,Liverpool School of Tropical Medicine, 2Research Computing Unit,Liverpool School of Tropical Medicine, 3Department of Immunology and Infectious Diseases,Harvard T.H. Chan School of Public Health

Chapters

  • 00:04Title
  • 00:30Using the IR-TEx Web Application
  • 03:57Downloading and Implementing IR-TEx Locally
  • 04:52Modifying IR-TEx for use with Different Datasets
  • 06:05Results: Microsomal GST Contributes to Insecticide Resistance in Anopheles gambiae and Anopheles coluzzii Mosquitoes from Cte D Ivoire and Burkina Faso
  • 07:31Conclusion

Summary

자동 번역

자동 번역

IR-TEx Utforsker insektmiddel motstand-relaterte transcriptional profiler i arten Anopheles gambiae. Forutsatt her er full instruksjoner for bruk av programmet, modifikasjoner for å utforske flere transcriptomic datasett, og bruke rammeverket til å bygge en interaktiv database for samlinger av transcriptomic data fra alle organisme, generert i noen plattform.

Tags

Data IntegrationTranscriptomicsAnopheles GambiaeIR-TExWeb ApplicationGene ExpressionInsecticide ResistancePyrethroidAnopheles ColuzziiFold ChangeAdjusted P-valueData Download

Article

Embed

플레이리스트에 추가

Usage Statistics

Related Videos

Protocol for Mosquito Rearing (A. gambiae)

Population Replacement Strategies for Controlling Vector Populations and the Use of Wolbachia pipientis for Genetic Drive

Protocol for RNAi Assays in Adult Mosquitoes (A. gambiae)

Building a Better Mosquito: Identifying the Genes Enabling Malaria and Dengue Fever Resistance in A. gambiae and A. aegypti Mosquitoes

Arbeidsflyt for High-innhold, Individuell Cell Kvantifisering av Fluorescent Markers fra Universal Microscope data, som støttes av Open Source Software

RNAi Trigger Levering inn<em> Anopheles gambiae</em> puppe

En effektiv In Vitro transponering metode av Transcriptionally regulert sovende skjønnhet pakket i en integrasjon defekt Lentiviral vektor

Orm-juster og Worm_CP, to åpen kildekode rørledninger for retting og kvantifisering av fluorescens bildedata hentet fra Caenorhabditis elegans

Effektiv Oral RNA Interference (RNAi) Administrasjon til Voksne Anopheles gambiae Mygg

De novo Identifisering av aktivt oversatte åpne leserammer med ribosomeprofileringsdata

Read Article