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전체 게놈 나노기공 시퀀싱 검증, 우스투 바이러스를 예로 사용

JoVE 신문
유전학

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JoVE 신문 유전학

Validating Whole Genome Nanopore Sequencing, using Usutu Virus as an Example

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전체 게놈 나노기공 시퀀싱 검증, 우스투 바이러스를 예로 사용

DOI:

10.3791/60906-v

•

05:45 min

•

March 11, 2020

•

Bas B. Oude Munnink, David F. Nieuwenhuijse, Reina S. Sikkema, Marion Koopmans

¹ErasmusMC, Department of Viroscience, WHO Collaborating Centre for Arbovirus and Viral Hemorrhagic Fever Reference and Research,Erasmus University Medical Center

Chapters

00:04Introduction
00:59Nanopore Data Consensus Sequence Generation
02:33Nanopore Sequencing Error Profile Compensation
03:54Results: Representative Nanopore Sequencing Error Rate Overview
04:58Conclusion

Summary

자동 번역

우리는 이전에 나노 기공 시퀀싱 플랫폼에서 앰플리코 기반 전체 게놈 우스투 바이러스 (USUV) 시퀀싱에 대한 프로토콜을 검증했습니다. 여기서, 보다 자세하게 사용되는 방법을 설명하고 나노기공 R10 유량 셀의 오차율을 결정한다.

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