Journal
/
유전학
/
Validere hele genomet Nanopore sekvensering, ved hjelp av Usutu Virus som eksempel
JoVE 신문
유전학
This content is Free Access.
JoVE 신문 유전학
Validating Whole Genome Nanopore Sequencing, using Usutu Virus as an Example

Validere hele genomet Nanopore sekvensering, ved hjelp av Usutu Virus som eksempel

DOI:
10.3791/60906-v

•

05:45 min

•

March 11, 2020

•

, , ,
1ErasmusMC, Department of Viroscience, WHO Collaborating Centre for Arbovirus and Viral Hemorrhagic Fever Reference and Research,Erasmus University Medical Center

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 00:59Nanopore Data Consensus Sequence Generation
  • 02:33Nanopore Sequencing Error Profile Compensation
  • 03:54Results: Representative Nanopore Sequencing Error Rate Overview
  • 04:58Conclusion

Summary

자동 번역

자동 번역

Vi har tidligere validert en protokoll for amplicon-basert hele genomet Usutu virus (USUV) sekvensering på en nanopore sekvensering plattform. Her beskriver vi metodene som brukes mer detaljert og bestemmer feilfrekvensen til nanopore R10-strømningscellen.

Tags

Artificial IntelligenceAI Writing AssistantsCopywritingContent GenerationText-based ContentContent CreationAI-assisted WritingWriter’s BlockContent EfficiencyReal-time SequencingVirus Genetic SequencingNanopore SequencingUsutu VirusError RateRead CoverageSequence DataConsensus SequenceReference-based AlignmentMinimap2SamtoolsKMA

Article

Embed

플레이리스트에 추가

Usage Statistics

Related Videos

check_url/kr/60906?article_type=v

Kartlegging av RNA-RNA-interaksjoner globalt ved bruk av biotinylert psoralen
check_url/kr/60906?article_type=v

Generasjon av innfødte Chromatin Immunoprecipitation sekvensering biblioteker til Nucleosome tetthet analyse
check_url/kr/60906?article_type=v

G2-seq: En høy gjennomstrømning sekvensering-basert teknikk for å identifisere sent replikere regioner i genomet
check_url/kr/60906?article_type=v

Profilering DNA replikering Timing bruker sebrafisk som en In Vivo modellsystem
check_url/kr/60906?article_type=v

Sjelden hendelse gjenkjenning feil-korrigert DNA og RNA sekvensering
check_url/kr/60906?article_type=v

Ultralow inngang genomet sekvensering biblioteket forberedelse fra en enkelt Tardigrade prøven
check_url/kr/60906?article_type=v

Forsterkning av nær full lengde HIV-1-Proviruses for neste generasjons sekvensering
check_url/kr/60906?article_type=v

Genomet redigering i pattedyr linjer med CRISPR-Cas
check_url/kr/60906?article_type=v

Sekvensering av mRNA fra hele Blood bruke Nanopore sekvensering
check_url/kr/60906?article_type=v

Identifikasjon av sirkulær RNAs ved hjelp av RNA-sekvensering

Read Article