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Preparação da amostra TMT para envio de instalações proteômicas e análise de dados subsequentes
JoVE 신문
생화학
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JoVE 신문 생화학
TMT Sample Preparation for Proteomics Facility Submission and Subsequent Data Analysis

Preparação da amostra TMT para envio de instalações proteômicas e análise de dados subsequentes

DOI:
10.3791/60970-v

•

07:44 min

•

June 08, 2020

•

, , ,
1Department of Pediatrics,University of Florida

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 00:31Protein Extraction
  • 01:40Reducing/Alkylating Reagent Treatment
  • 02:39Methanol/Chloroform Precipitation
  • 04:20Protein Digestion
  • 04:56Peptide Labeling
  • 05:57Results: Representative Protein Quantification and Volcano Plot and Protein Analysis through Evolutionary Relationships (PANTHER) Analyses
  • 07:04Conclusion

Summary

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Apresentamos um protocolo de rotulagem de etiquetagem tandem (TMT) otimizado que inclui informações detalhadas para cada uma das seguintes etapas: extração de proteínas, quantificação, precipitação, digestão, rotulagem, submissão a uma instalação de proteômica e análises de dados.

Tags

TMT Sample PreparationProteomicsProtein ExtractionLabeling EfficiencyReproducibilityData AcquisitionCHAPS Lysis BufferBead DisruptorSonicationReducing/alkylating Reagent TreatmentTCEPIodoacetamideMethanol/chloroform Precipitation

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