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Chapters
- 00:04Introduction
- 00:36Bottom-Up Liquid Chromatography-Mass Spectrometry (LC-MS) Reference Sample Workflow Preparation
- 01:18Reference Data Processing and Peptide List Definition
- 05:05Hydrogen-Deuterium Exchange (HDX) Reactions
- 06:36HDX Data Processing, Analysis, and Visualization
- 09:03Results: Reapresentative HDX-MS Peptide Biosynthetic Enzyme Evaluation
- 10:44Conclusion
Le sintetasi lanthipeptide catalizzano reazioni multistep durante la biosintesi dei prodotti naturali peptidici. Qui descriviamo un flusso di lavoro continuo, dal basso verso l'alto, di spettrometria di massa a scambio idrogeno-deuterio (HDX-MS) che può essere utilizzato per studiare la dinamica conformazionale delle sintetasi lantaipeptide, così come altri enzimi simili coinvolti nella biosintesi del prodotto naturale peptidico.
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Hydrogen-Deuterium Exchange Mass Spectrometry (HDX-MS)Protein Conformational DynamicsProtein Of InterestQuench BufferBottom-up Liquid Chromatography Mass SpectrometryProteomic Software ProgramFASTA FormatElectrospray MSEGlucan One Fiber No Peptide BNonspecific DigestCarbamidomethyl CApex 3DPeptide 3DIon Accounting
