Lanthipeptide synthetases katalyserer multistep reaksjoner under biosyntesen av peptid naturlige produkter. Her beskriver vi en kontinuerlig, nedenfra-og-opp, hydrogen-deuterium utveksling masse spektrometri (HDX-MS) arbeidsflyt som kan brukes til å studere konformasjonsdynamikken til lanthipeptid synthetaser, samt andre lignende enzymer involvert i peptid naturlig produkt biosyntese.