Journal
/
/
Högupplöst kartläggning av protein-DNA-interaktioner i musstamcellsbaserade nervceller med chromatinimmunprecipitation-exonukleas (ChIP-Exo)
JoVE 신문
유전학
JoVE 비디오를 활용하시려면 도서관을 통한 기관 구독이 필요합니다.  전체 비디오를 보시려면 로그인하거나 무료 트라이얼을 시작하세요.
JoVE 신문 유전학
High-Resolution Mapping of Protein-DNA Interactions in Mouse Stem Cell-Derived Neurons using Chromatin Immunoprecipitation-Exonuclease (ChIP-Exo)
DOI:

08:40 min

August 14, 2020

,

Chapters

  • 00:05Introduction
  • 00:21Antibody Incubation with Beads
  • 01:35Chromatin Immunoprecipitation (ChIP)
  • 02:56Enzymatic Reactions on Beads
  • 04:59Elution and Purification
  • 05:43Library Preparation
  • 06:50Results: ChIP-exo Produces High Mapping Resolution
  • 08:04Conclusion

Summary

자동 번역

Exakt bestämning av proteinbindande platser i genomet är viktigt för att förstå genreglering. Här beskriver vi en genomisk kartläggningsmetod som behandlar chromatin-immunoprecipitated DNA med exonuklease matsmältning (ChIP-exo) följt av hög genomströmning sekvensering. Denna metod detekterar protein-DNA interaktioner med nära bas-par mappning upplösning och hög signal-till-brus förhållandet i däggdjur nervceller.

Related Videos

Read Article