Presenteras här är ett protokoll för laser-capture microdissection (LCM) av växtvävnader. LCM är en mikroskopisk teknik för att isolera områden av vävnad på ett kontaminationsfritt sätt. Förfarandet omfattar vävnad fixering, paraffin inbäddning, snittning, LCM och RNA extraktion. RNA används i den nedströms vävnadsspecifika, tidsmässigt löst analys av transkriptomer.