Mapping the Structure-Function Relationships of Disordered Oncogenic Transcription Factors Using Transcriptomic Analysis

00:04Introduction
00:55In Vitro Construct Panel Setup
02:07Cell Collection
02:47Construct Expression Validation and Correlative Phenotypic Assay Setup
03:50Alignment and Transcript Counting Pipeline
05:32Differential Expression
07:40Results: Representative Disordered Oncogenic Transcription Factor Structure-Function Relationship Mapping
09:31Conclusion

Summary

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I domini intrinsecamente disordinati sono importanti per la funzione del fattore di trascrizione di fusione oncogenica. Per indirizzare terapeuticamente queste proteine, è necessaria una comprensione più dettagliata dei meccanismi di regolazione impiegati da questi domini. Qui, usiamo la trascrittomica per mappare importanti caratteristiche strutturali del dominio EWS intrinsecamente disordinato nel sarcoma di Ewing.

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