Mapping the Structure-Function Relationships of Disordered Oncogenic Transcription Factors Using Transcriptomic Analysis

00:04Introduction
00:55In Vitro Construct Panel Setup
02:07Cell Collection
02:47Construct Expression Validation and Correlative Phenotypic Assay Setup
03:50Alignment and Transcript Counting Pipeline
05:32Differential Expression
07:40Results: Representative Disordered Oncogenic Transcription Factor Structure-Function Relationship Mapping
09:31Conclusion

Summary

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Los dominios intrínsecamente desordenados son importantes para la función del factor de transcripción de fusión oncogénica. Para dirigirse terapéuticamente a estas proteínas, se requiere una comprensión más detallada de los mecanismos reguladores empleados por estos dominios. Aquí, utilizamos transcriptómica para mapear características estructurales importantes del dominio EWS intrínsecamente desordenado en el sarcoma de Ewing.

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