Infektion av neonatal möss med bioluminescerande E. coli O1:K1:H7 resulterar i en septisk infektion med betydande pulmonell inflammation och lung patologi. Här beskriver vi förfaranden för att modellera och ytterligare studera neonatal sepsis med hjälp av längsgående intravital imaging parallellt med uppräkning av systematiska bakteriebördor, inflammatorisk profilering och lung histopatologi.