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Um procedimento de ChIP-Seq semiautônomo para estudos epigenéticos em larga escala
JoVE 신문
생물학
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JoVE 신문 생물학
A Semiautomated ChIP-Seq Procedure for Large-scale Epigenetic Studies
DOI:

08:04 min

August 13, 2020

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Chapters

  • 00:05Introduction
  • 00:26Chromatin Shearing
  • 01:28Automated Chromatin Immunoprecipitation Sequencing (ChIP-Seq)
  • 03:03Library Adaptor Transposase Integration
  • 03:49Tagmented DNA Fragment Purification
  • 04:46Purified Sample Amplification and Size-Selection
  • 05:44Results: Representative Semiautomated ChIP-Seq
  • 07:27Conclusion

Summary

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Este artigo descreve um protocolo chip-seq semiautomado e microescalado de regiões de DNA associadas a uma modificação de histona específica (H3K27ac) usando uma plataforma de manipulador de líquidos ChIP, seguido de preparação da biblioteca usando tagmentação. O procedimento inclui avaliação de controle para fins de qualidade e quantidade e pode ser adotado para outras modificações de histona ou fatores de transcrição.

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