Journal
/
생물학
/
Un pipeline bioinformatique pour étudier l’évolution moléculaire et l’expression génique à l’aide de l’ARN-seq
JoVE 신문
생물학
JoVE 비디오를 활용하시려면 도서관을 통한 기관 구독이 필요합니다.  전체 비디오를 보시려면 로그인하거나 무료 트라이얼을 시작하세요.
JoVE 신문 생물학
A Bioinformatics Pipeline for Investigating Molecular Evolution and Gene Expression using RNA-seq
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Un pipeline bioinformatique pour étudier l’évolution moléculaire et l’expression génique à l’aide de l’ARN-seq

DOI:
10.3791/61633-v

•

07:09 min

•

May 28, 2021

•

,
1Department of Developmental and Cell Biology,University of California, Irvine

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 00:44Obtain RNA-seq Reads and Reference Assembly
  • 01:57Identify Genes of Interest
  • 03:32Phylogenetic Trees
  • 04:21Results: Opsin Genes in Hydra vulgaris
  • 06:20Conclusion

Summary

자동 번역

자동 번역

Le but de ce protocole est d’étudier l’évolution et l’expression des gènes candidats à l’aide de données de séquençage de l’ARN.

Tags

Bioinformatics PipelineMolecular EvolutionGene ExpressionRNA-seqSRA ToolkitNCBIFASTQReference GenomeGTFFASTAGene MappingGene ExpressionBLASTHomologous GenesGene AnnotationMEGA

Article

Embed

플레이리스트에 추가

Usage Statistics

Related Videos

Molecular Evolution de la recombinase Tre

La préparation des cultures primaires de cellules hématopoïétiques de la moelle osseuse murine pour l'électroporation

Utilisation du système d'électroporation Gene Pulser MXcell à transfecter des cellules primaires à haut rendement

Aide d'un compteur de cellules automatisé pour simplifier les études d'expression génique: Knockdown siRNA de l'IL-4 dans l'expression des gènes dépendant cellules Namalwa

Les articles inclus en paraffine et congelés de Drosophile

La reconstitution in vitro de l'actif T. La télomérase castaneum

Un protocole pour la structure des protéines Computer-Based et prédiction de la fonction

Analyse de Global ARN de synthèse à la Cellule Plain suivante hypoxie

Mesure des taux métabolique dans<em> Drosophila</em> En utilisant Respirométrie

Un protocole expérimental et de la bioinformatique pour les analyses d'ARN-Seq de la photopériode diapause dans le Asian Tiger Mosquito,<em> Aedes albopictus</em

Read Article