Journal
/
생화학
/
液体クロマトグラフィー質量分析とバイオインフォマティクスによるペプチドグリカンの半定量分析
JoVE 신문
생화학
JoVE 비디오를 활용하시려면 도서관을 통한 기관 구독이 필요합니다.  전체 비디오를 보시려면 로그인하거나 무료 트라이얼을 시작하세요.
JoVE 신문 생화학
Semi-Quantitative Analysis of Peptidoglycan by Liquid Chromatography Mass Spectrometry and Bioinformatics
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

液体クロマトグラフィー質量分析とバイオインフォマティクスによるペプチドグリカンの半定量分析

DOI:
10.3791/61799-v

•

09:09 min

•

October 13, 2020

•

, , ,
1Department of Molecular and Cellular Biology,University of Guelph, 2Mass Spectrometry Facility,University of Guelph

Chapters

  • 00:05Introduction
  • 01:07Peptidoglycan Sacculi Extraction
  • 03:17Liquid Chromatography-Mass Spectrometry (LC-MS) Chromatogram Spectral Processing
  • 04:11Differential Spectral Feature Analysis
  • 05:06Muropeptide Annotation Spectral Features
  • 06:18Muropeptide Global Change Modification Assessment
  • 07:07Results: Representative Muropeptide Fragmentation and Identification and Peptidoglycan Composition Analysis
  • 08:31Conclusion

Summary

자동 번역

자동 번역

このプロトコルは、液体クロマトグラフィー質量分析と高度な特徴抽出およびバイオインフォマティクス分析ソフトウェアを組み合わせたペプチドグリカン組成の詳細な分析をカバーしています。

Tags

PeptidoglycanMass SpectrometryBioinformaticsPeptidoglycomicsSacculi ExtractionSDS TreatmentEnzymatic DigestionLiquid Chromatography-mass Spectrometry

Article

Embed

플레이리스트에 추가

Usage Statistics

Related Videos

時間分解エレクトロスプレーイオン化水素 - 重水素交換質量分析タンパク質の構造とダイナミクスを学ぶために

ブルーネイティブPAGEおよびタンパク質相関プロファイリングによってアフィニティー精製タンパク質複合体の解決

代謝産物分析のためのタンデム液体クロマトグラフィー - 質量分析に基づくアプローチ<em>黄色ブドウ球菌</em

定量的質量分析のための脂肪滴の分離

定圧ラベリング、豊富な液体クロマトグラフィー、質量分析法、およびソフトウェアによる定量化して深いプロテオームをプロファイリング

ペプチド濃縮と質量分析によるタンパク質ユビキチン化部位の検出

アンジオテンシンIIによるニトロペプチドプロファイリングと同定

アフィニティクロマトグラフィーによるインノシトールリン酸塩またはホスホイノシチド相互作用タンパク質の同定

逆相液体クロマトグラフィー-質量分析法による無細胞タンパク質合成代謝の絶対定量

液体クロマトグラフィーとタンデム質量分析法を用いたサッカロミセス・セレビシエ細胞リピドームの定量的解析

Read Article