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卵巣組織における細菌の特性評価と機能予測
JoVE 신문
암 연구학
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JoVE 신문 암 연구학
Characterization and Functional Prediction of Bacteria in Ovarian Tissues
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卵巣組織における細菌の特性評価と機能予測

DOI:
10.3791/61878-v

•

10:12 min

•

October 23, 2021

•

, , , , , , , , , , , ,
1Department of Obstetrics and Gynecology,First Affiliated Hospital of Xi’an Jiaotong University, 2School of Social Sciences,University of Manchester, 3Department of Pathology,First Affiliated Hospital of Xi’an Jiaotong University, 4Omega Bioservices Inc

Chapters

  • 00:03Introduction
  • 01:10Collect Samples
  • 01:47Perform Bacterial LPS’s: Immunohistochemistry in Ovaries
  • 03:50Detect 16S rRNA Sequencing
  • 05:0216S rRNA Sequencing Analysis
  • 06:09Predict Bacteria Function
  • 06:36Data
  • 07:09Representative Result
  • 09:47Conclusion

Summary

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免疫組織化学染色と16SリボソームRNA遺伝子(16S rRNA遺伝子)シーケンシングを行い、癌性および非癌性卵巣組織の細菌を発見し、その場で区別した。バクテリアの組成と機能の違いは、未観測状態の再構築によるBugBaseおよび系統的なコミュニティの調査(PICRUSt)を用いて予測した。

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Keywords: BacteriaImmunohistochemistry16S RRNA SequencingCharacterizationFunctional PredictionCancerNon-cancerBoPsCellular-genetic InvestigationIn SituParaffin EmbeddingAntigen RetrievalAntibody StainingDAP SubstrateHRP PolymerDehydration16S RRNA Sequencing Library Preparation

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