Denne protokollen isolerer total RNA av høy kvalitet fra fekale prøver av dyr og mennesker. Et kommersielt miRNA-isolasjonssett brukes med betydelig tilpasning for å isolere rent RNA med optimalisert kvantitet og kvalitet. RNA-isolatene er gode for de fleste nedstrøms RNA-analyser som sekvensering, mikro-array og RT-PCR.