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Perfil metabólico de alta produtividade para refinamentos de modelo de microalgas
JoVE 신문
생물학
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JoVE 신문 생물학
High-Throughput Metabolic Profiling for Model Refinements of Microalgae

Perfil metabólico de alta produtividade para refinamentos de modelo de microalgas

DOI:
10.3791/61913-v

•

11:07 min

•

December 04, 2021

•

, , , , , , , ,
1Center for Genomics and Systems Biology (CGSB),New York University Abu Dhabi Research Institute, 2Department of Biology,United Arab Emirates University, 3Laboratory of Algal, Systems, and Synthetic Biology (LASSB), Division of Science and Math,New York University Abu Dhabi, 4Department of Marine Science, Ocean College,Zhejiang University

Chapters

  • 00:07Introduction
  • 01:13Phenotype Microarray Experiments
  • 03:58Data Extraction and Analysis
  • 05:06Identification of Reactions and Genes Associated with New Metabolites
  • 06:41Model Refinement and Evaluation
  • 08:38Results
  • 10:25Conclusion

Summary

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Este protocolo demonstra o uso de uma plataforma tecnológica de microarray fenotipo (PM) para definir os requisitos metabólicos de Chlamydomonas reinhardtii, uma microalga verde, e refinar um modelo de rede metabólica existente.

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Keywords: Metabolic ProfilingMicroalgaePhenotype Micro-arrayHigh-throughputChlamydomonas ReinhardtiiMetabolic Network ModelsTetrazolium-based Redox DyeCarbon SourcesNitrogen SourcesPhosphorusSulfurPeptide Nitrogen SourcesHeterotrophic RespirationMicroplate Reader

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