Vi beskriver ett protokoll för att prova, bevara och dela upp intakta rötter och den omgivande rhizosfärjorden från våtmarksmiljöer medris (Oryza sativa L.) som modellart. När provet har bevarats kan det analyseras med hjälp av elementära bildframställningstekniker, såsom synkrotronröntgenfluorescens (XRF) kemisk speciation imaging.