Journal
/
유전학
/
En virtuell maskinplattform for ikke-datamaskin fagfolk for bruk av dyp læring for å klassifisere biologiske sekvenser av metagenomiske data
JoVE 신문
유전학
Author Produced
JoVE 비디오를 활용하시려면 도서관을 통한 기관 구독이 필요합니다.  전체 비디오를 보시려면 로그인하거나 무료 트라이얼을 시작하세요.
JoVE 신문 유전학
A Virtual Machine Platform for Non-Computer Professionals for Using Deep Learning to Classify Biological Sequences of Metagenomic Data

En virtuell maskinplattform for ikke-datamaskin fagfolk for bruk av dyp læring for å klassifisere biologiske sekvenser av metagenomiske data

DOI:
10.3791/62250-v

•

09:34 min

•

September 25, 2021

•

,
1Microbiome Medicine Center, Department of Laboratory Medicine, Zhujiang Hospital,Southern Medical University, 2Center for Quantitative Biology,Peking University, 3State Key Laboratory of Organ Failure Research,Southern Medical University

Chapters

  • 00:07Introduction
  • 01:35The Installation of the Virtual Machine
  • 04:11Create Shared Folders and Prepare the Files for the Training Set and Test Set
  • 06:55Digitize the Biological Sequences Using “One‐Shot” Encoding Form
  • 07:27Train and Test the Artificial Neural Network
  • 08:12Result
  • 08:52Conclusion

Summary

자동 번역

자동 번역

Denne opplæringen beskriver en enkel metode for å konstruere en dyp læringsalgoritme for å utføre 2-klasse sekvensklassifisering av metagenomiske data.

Tags

Keywords: Virtual MachineDeep LearningBiological Sequence ClassificationMetagenomic DataSpecies ClassificationGene Function ClassificationHost ClassificationDeep Learning FrameworkSequence ClassificationVirtualBoxUbuntu

Article

Embed

플레이리스트에 추가

Usage Statistics

Related Videos

check_url/kr/62250?article_type=v

En robot plattform for High-throughput Protoplast Isolering og Transformation
check_url/kr/62250?article_type=v

Forstyrrelser av sirkulerende mirnas i Irritabel tarm syndrom oppdages ved hjelp av en multiplekset Høy throughput Gene Expression Platform
check_url/kr/62250?article_type=v

Metagenomic Analyse av Silo
check_url/kr/62250?article_type=v

Ved hjelp av en GFP-merket TMEM184A Construct for bekreftelse av Heparin Receptor Identity
check_url/kr/62250?article_type=v

Protokoller for C-Brick DNA Standard Assembly Bruke Cpf1
check_url/kr/62250?article_type=v

Robust DNA isolasjon og høy gjennomstrømming sekvensering biblioteket konstruksjon for Herbarium prøver
check_url/kr/62250?article_type=v

CRISPR/Cas9-mediert målrettet integrering i Vivo med en homologi-mediert slutten begynte-basert strategi
check_url/kr/62250?article_type=v

Informatic analyse av sekvens Data fra satsvis gjær 2-Hybrid-skjermer
check_url/kr/62250?article_type=v

Høy gjennomstrømming identifikasjon av regulatoriske gensekvenser med neste generasjons sekvensering av runde kromosom konformasjon fange (4C-seq)
check_url/kr/62250?article_type=v

En dyp-sekvensering-assistert, spontane Suppressor skjerm i fisjon gjær Schizosaccharomyces pombe

Read Article