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FASP消化とデータ非依存分析によるEPS-尿のプロテオミクスプロファイル
JoVE 신문
생화학
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JoVE 신문 생화학
Proteomic Profile of EPS-Urine through FASP Digestion and Data-Independent Analysis
DOI:

14:48 min

May 08, 2021

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Chapters

  • 00:00Introduction
  • 00:55Protocol
  • 01:25Protocol: FASP Digestion
  • 05:29Protocol: SCX Purification
  • 08:08Protocol: Protein Quantifcation by External Standard
  • 09:23Protocol: NanoLC-MS/MS and DIA Analysis
  • 11:31Protocol: High-pH C18 Fractionation for Spectral Library
  • 13:09Protocol: Data Analysis
  • 13:35Expected Results
  • 13:53Conclusion

Summary

자동 번역

ここでは、タンパク質消化、ペプチド精製、データ独立獲得分析に関する詳細情報を含む最適化されたオンフィルター消化プロトコルを提示します。この戦略は、発現した前立腺分泌尿サンプルの分析に適用され、高いプロテオームカバレッジと尿プロテオームの低欠損値ラベルフリープロファイリングを可能にします。

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