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Capturando compostos orgânicos voláteis microbianos produzidos ativamente a partir de amostras associadas ao homem com extração sorbent assistida a vácuo
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JoVE 신문 생화학
Capturing Actively Produced Microbial Volatile Organic Compounds from Human-Associated Samples with Vacuum-Assisted Sorbent Extraction

Capturando compostos orgânicos voláteis microbianos produzidos ativamente a partir de amostras associadas ao homem com extração sorbent assistida a vácuo

DOI:
10.3791/62547-v

•

09:19 min

•

June 01, 2022

•

, , , , , ,
1Department of Molecular Biology and Biochemistry,University of California Irvine, 2Department of Ecology and Evolutionary Biology,University of California Irvine, 3Entech Instruments Inc.

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 00:59Stable Isotope Probing in Biological Samples Preparation
  • 02:17Sample Extraction
  • 04:10Analyze Samples on the Gas Chromatography Mass Spectrometer (GC-MS)
  • 04:56Data Analysis
  • 05:45Results: GC-MS, Heatmaps, and Data Analysis of the 13C-Labeled Volatiles in Fecal, Saliva, Sewage, Cultured and Uncultured Sputum Samples
  • 08:24Conclusion

Summary

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Este protocolo descreve a extração de compostos orgânicos voláteis de uma amostra biológica com o método de extração sorbent assistido a vácuo, cromatografia gasosa juntamente com espectrometria de massa usando o Entech Sample Preparation Rail e análise de dados. Também descreve a cultura de amostras biológicas e sondagem de isótopos estáveis.

Tags

Keywords: Microbial Volatile Organic CompoundsVASEVacuum-assisted Sorbent ExtractionVolatile MetabolitesBiomarker DiscoveryFecal SamplesSewage SamplesSaliva SamplesSputum SamplesVOA VialsCold Plate13C GlucoseDeuteriumBHI MediumTechnical Triplicates

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