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Identificazione di splicing alternativo e poliadenilazione in dati di RNA-seq
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JoVE 신문 생물학
Identification of Alternative Splicing and Polyadenylation in RNA-seq Data
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Identificazione di splicing alternativo e poliadenilazione in dati di RNA-seq

DOI:
10.3791/62636-v

•

08:35 min

•

June 24, 2021

•

, , ,
1Department of Genome Sciences, The John Curtin School of Medical Research,The Australian National University, 2Department of Biology,New York University

Chapters

  • 00:05Introduction
  • 00:51Alternative Splicing (AS) Analysis Using RNA-Seq
  • 06:02Results: Alternative Splicing and Polyadenylation in RNA-Seq Data
  • 07:46Conclusion

Summary

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Lo splicing alternativo (AS) e la poliadenilazione alternativa (APA) espandono la diversità delle isoforme di trascrizione e dei loro prodotti. Qui, descriviamo i protocolli bioinformatici per analizzare i saggi di sequenziamento di massa dell'RNA-seq e 3' per rilevare e visualizzare AS e APA che variano in base alle condizioni sperimentali.

Tags

Alternative SplicingPolyadenylationRNA-seqDifferential SplicingDifferential Exon ExpressionLimmaEdgeRVoomDiffSplice

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