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Identificação de Splicing Alternativo e Poliadenilação em Dados de RNA-seq
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JoVE 신문 생물학
Identification of Alternative Splicing and Polyadenylation in RNA-seq Data

Identificação de Splicing Alternativo e Poliadenilação em Dados de RNA-seq

DOI:
10.3791/62636-v

•

08:35 min

•

June 24, 2021

•

, , ,
1Department of Genome Sciences, The John Curtin School of Medical Research,The Australian National University, 2Department of Biology,New York University

Chapters

  • 00:05Introduction
  • 00:51Alternative Splicing (AS) Analysis Using RNA-Seq
  • 06:02Results: Alternative Splicing and Polyadenylation in RNA-Seq Data
  • 07:46Conclusion

Summary

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O splicing alternativo (AS) e a poliadenilação alternativa (APA) expandem a diversidade de isoformas de transcritos e seus produtos. Aqui, descrevemos protocolos de bioinformática para analisar ensaios de RNA-seq em massa e sequenciamento final de 3' para detectar e visualizar AS e APA variando entre condições experimentais.

Tags

Alternative SplicingPolyadenylationRNA-seqDifferential SplicingDifferential Exon ExpressionLimmaEdgeRVoomDiffSplice

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