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大規模マルチオミクスゲノムワイド関連研究(Mo-GWAS):サンプル調製と正規化のためのガイドライン

JoVE 신문
생화학

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JoVE 신문 생화학

Large-Scale Multi-Omics Genome-Wide Association Studies (Mo-GWAS): Guidelines for Sample Preparation and Normalization

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大規模マルチオミクスゲノムワイド関連研究(Mo-GWAS):サンプル調製と正規化のためのガイドライン

DOI:

10.3791/62732-v

•

08:27 min

•

July 27, 2021

•

Mustafa Bulut, Alisdair R. Fernie², Saleh Alseekh²

¹Max-Planck-Institute of Molecular Plant Physiology, ²Center of Plant Systems Biology and Biotechnology

Chapters

00:04Introduction
00:48Preparation of Biological Plant Material
01:57Sample Extraction
03:35UHPLC-MS Analysis of Semi-Polar Metabolites and Normalization of Large-Scale Metabolomics Dataset
05:37Genome-Wide Association Studies (GWAS)
06:26Results: Metabolomics Data Normalization and QTL Visualization
07:45Conclusion

Summary

자동 번역

このプロトコルでは、多くのサンプルの効率的で迅速なサンプル調製を組み合わせた最適化されたワークフローを紹介します。さらに、代謝GWAS研究のハイスループット評価のための分析変動を減らすためのステップバイステップガイドを提供します。

Tags

Multi-omics Genome-wide Association Studies Mo-GWAS Sample Preparation Normalization Technical Variation Biological Variance Metabolites Analytical Platform Genotypic Information Phenotypic Information Natural Population Flash Freezing Extraction Centrifugation Solvent Evaporation GCMS UHPLC-MS

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