Journal

생화학

JUMPn: יישום יעיל עבור אשכולות ביטוי משותף של חלבונים וניתוח רשת בפרוטאומיקה

JoVE 신문
생화학

JoVE 비디오를 활용하시려면 도서관을 통한 기관 구독이 필요합니다. 전체 비디오를 보시려면 로그인하거나 무료 트라이얼을 시작하세요.

JoVE 신문 생화학

JUMPn: A Streamlined Application for Protein Co-Expression Clustering and Network Analysis in Proteomics

Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

JUMPn: יישום יעיל עבור אשכולות ביטוי משותף של חלבונים וניתוח רשת בפרוטאומיקה

DOI:

10.3791/62796-v

•

07:28 min

•

October 19, 2021

•

David Vanderwall, Poudel Suresh², Yingxue Fu, Ji-Hoon Cho, Timothy I. Shaw³, Ashutosh Mishra, Anthony A. High, Junmin Peng², Yuxin Li²

¹Departments of Structural Biology and Developmental Neurobiology,St. Jude Children’s Research Hospital, ²Center for Proteomics and Metabolomics,St. Jude Children’s Research Hospital, ³Department of Computational Biology,St. Jude Children’s Research Hospital

Chapters

00:04Introduction
01:03Setup of JUMPn Software
01:31Demo Run Using an Example Dataset
06:04Results: Workflow of JUMPn Software and the Protein-Protein Interaction Database
07:00Conclusion

Summary

자동 번역

אנו מציגים כלי לביולוגיה של מערכות JUMPn כדי לבצע ולהמחיש ניתוח רשת עבור נתוני פרוטאומיקה כמותית, עם פרוטוקול מפורט הכולל עיבוד נתונים מראש, אשכולות ביטוי משותף, העשרת מסלולים וניתוח רשת אינטראקציות חלבון-חלבון.

JUMPn: יישום יעיל עבור אשכולות ביטוי משותף של חלבונים וניתוח רשת בפרוטאומיקה

•

•

•

Chapters

Summary

자동 번역

Tags

Article

Embed

플레이리스트에 추가

Usage Statistics

Related Videos

שיטה לזיהוי מולקולה קטנה מעכבים של האינטראקציה בין החלבונים בין HCN1 ו TRIP8b

בידוד אגל ליפידים על ניתוח כמותי ספקטרומטריית מסה

חלבון חוץ-תאית הטכנולוגיה Microarray לגילוי תפוקה גבוהה של אינטראקציות קולטן-ליגנד זיקה נמוכה

הכנת כלורופלסט תאי המשנה של תודרנית לניתוח של חלבון לוקליזציה Immunoblotting או פרוטאומיקס

ניתוח של קיפול חלבונים, תחבורה, והשפלה בתאים חיים על ידי הדופק רדיואקטיבי צ'ייס

איתור מקומות לגילוי החלבון על ידי העשרה מפפטיד וספקטרומטר מסה

יישום של ביואולייר אינטרפרומטריה (בלי) ללימוד אינטראקציות חלבונים-חלבונים בתמלול

קוונפיקציה של אינטראקציה חלבון ברשת דינמיקה באמצעות ריבוב ושות-Immunoprecipitation

PeptiQuick, שילוב של צעד אחד של חלבונים ממברנות לתוך ביוטילדיסקי Peptiquick עבור כריכת חלבון מפושטת

הכנה לדוגמא להגשת מתקנים פרוטאומניקס וניתוח נתונים שלאחר מכן

Read Article