Journal
/
/
הרכבה הגנום ההיברידית דה נובו לייצור גנומים שלמים של חיידקי השתן באמצעות טכנולוגיות רצף קצרות וארוכות
JoVE 신문
유전학
This content is Free Access.
JoVE 신문 유전학
Hybrid De Novo Genome Assembly for the Generation of Complete Genomes of Urinary Bacteria using Short- and Long-read Sequencing Technologies
DOI:

12:08 min

August 20, 2021

, , , , ,

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 01:00dsDNA Pool Cleanup and Concentration
  • 03:25Sequence the Genome Library
  • 05:14Long (MinION) Reads
  • 06:55Generating Hybrid Genome Assembly
  • 08:34Assessing Assembly Quality
  • 09:34Genome Annotation
  • 10:07Results: Analysis of Extracted DNA and Complete Genome Sequencing of Urinary Bacteria
  • 11:37Conclusion

Summary

자동 번역

פרוטוקול זה מפרט גישה מקיפה עבור כתות, רצף, ואת הרכב הגנום ההיברידי דה נובו של חיידקי השתן. הוא מספק הליך לשחזור ליצירת רצפי גנום מעגליים שלמים שימושיים בחקר יסודות גנטיים כרומוזומליים ואקסטרכרומוזומליים התורמים לקולוניזציה של שתן, פתוגנזה והפצת התנגדות מיקרוביאלית.

Related Videos

Read Article