Hybrid De Novo Genome Assembly för generering av kompletta genom av urinbakterier med kort- och långläsningssekvenseringsteknik

Detta protokoll beskriver en omfattande strategi för odling, sekvensering och de novo hybrid genom montering av urinvägsbakterier. Det ger ett reproducerbart förfarande för generering av kompletta, cirkulära genomsekvenser som är användbara för att studera både kromosomala och extrakromosomala genetiska element som bidrar till urinkolonisering, patogenes och antimikrobiell resistens spridning.